超声内镜检查比较准确率高，但也存在部分情况，会导致准确率降低。超声内镜是消化内镜的一种，与胃镜、结肠镜等相比，更加直观、准确地检查上消化道病变。

1、胃镜：胃镜是诊断上消化道疾病的常用手段，能观察到食管、胃、十二指肠球部和降部黏膜的情况。由于胃后壁是邻近食管的器官，在进行胃镜检查时，可能会对食管造成刺激。此外，由于胃后壁是紧贴着肠道的器官，在进行胃镜检查时，也有可能会对肠道造成影响，从而导致部分患者出现腹胀、恶心等症状;

2、结肠镜：结肠镜也称为纤维结肠镜，可观察到结肠、直肠的具体情况。但相对于胃镜而言，清晰度较差，而且需要通过拐弯弯曲肠道来进行观察，因此不容易被发现病变。如果患者存在一些肠道息肉或者是不明原因的出血，需通过肠镜进行检查，此时超声内镜的准确率更高;

3、小肠镜：小肠镜也称为小肠镜，可以通过口服气泵或者水流，将小肠内的气体或者是食物推送到小肠，以观察小肠是否存在病变。此外，由于小肠位于腹部，在进行小肠镜检查时，可能会因为小肠的气体影响到病变部位的检出;

4、胶囊内窥镜：此检查是将特制的内窥镜吞服聚于体内，通过体内的微型照相机摄取图像来进行观察。通常无需进行麻醉，也不会引起不适或疼痛，较为安全。

此外，超声内镜在临床中还可用于食管、胃、十二指肠的检查，其操作简单、便捷，而且价格较低，应用广泛。