超声检查发现胎儿染色体异常，其原因较多，可能与遗传因素、环境因素、药物因素、物理因素等有关，需要根据不同原因进行相应处理。

1、遗传因素：染色体异常一般是指染色体数目或结构异常，以及其他部位结构异常。常见的异常染色体有21-三体综合征、18-三体综合征、13-三体综合征等，其中21-三体综合征与母亲高龄、遗传有关，会导致胎儿智力低下、生长发育迟缓、面容异常。超声检查发现胎儿有染色体异常时，建议孕中期引产，放弃胎儿。对于坚持要生的唐氏儿，双方家族中有唐氏综合征患者的夫妻，建议进行遗传咨询和产前诊断;

2、环境因素：孕期前后，孕妇生活习惯不好，长期熬夜、吸烟、饮酒、接触有毒有害物质，或者孕妇年龄过大，都会导致胎儿染色体异常。因此，孕妇在孕期要注意休息，避免熬夜，戒烟戒酒，远离有毒有害物质，同时积极进行产前诊断;

3、药物因素：如果孕妇在孕期前后，服用过致畸性的药物，如四环素、农药等，也会导致胎儿染色体异常。因此孕妇在孕期要做好产前筛查和产前诊断，避免药物影响;

4、物理因素：如果孕妇在孕期受到辐射，也可能会导致胎儿染色体异常。因此，孕妇在孕期要避免接触辐射，避免前往辐射严重的场所。

如果通过上述方法，超声检查发现胎儿存在染色体异常的可能性。此时不建议继续妊娠，建议及时终止妊娠。