新生儿超声检查总有问题可能是因为超声检查时出现了操作失误、机器存在问题、超声检查时间过长等原因导致，建议根据具体情况进一步分析。

1、操作失误：超声检查时，因为各种因素可能会导致观察不仔细或者不准确，尤其是医生没有看清病变的情况下，就可能会导致新生儿超声检查总会有点问题，建议仔细观察，检查时多注意让新生儿配合;

2、机器存在问题：超声仪器各个方面均存在问题，如探头性能出现了问题，或者机器出现了损坏，均有可能导致新生儿超声检查总会有点问题，此时建议更换新的机器进行检查;

3、超声检查时间过长：如果新生儿做超声检查时时间过长，也可能会导致超声检查总会有点问题，因为新生儿对病变的耐受力比较差，长时间超声检查可能会出现哭闹导致，建议在合适的时间段进行超声检查;

4、其他：新生儿做超声检查时，如果因为心脏搏动过弱，导致医生看不清病变，也可能会导致超声检查总会有点问题。另外，如果医生技术欠佳，导致超声检查的结果出现误差等，也可能会导致新生儿超声检查总会有点问题。

如果新生儿超声检查总会有点问题，建议及时与医生沟通，医生会根据新生儿的具体情况进行复查或者完善其他检查。平时家长应注意新生儿的护理，给新生儿穿宽松、棉质的衣物，避免衣物对新生儿皮肤产生摩擦等。