胃肠超声检查和胃镜检查的区别主要在于检查原理不同、侧重点不同、检查的方法不同、价格不同四方面。建议在医生指导下，根据自身情况选择合适的检查方式。

1、检查原理不同：胃肠超声检查是利用超声对胃肠进行检查，通过体外无线电波对人体进行检查。而胃镜是使用质子泵将胃镜从口腔内进入，能直接观察到食道、胃和十二指肠的病变;

2、侧重点不同：胃肠超声检查可以通过超声波的物理性质，来观察胃肠道内的病变。而胃镜则是从口腔内进入，可以清楚地观察到食管、胃和十二指肠的病变;

3、检查的方法不同：胃肠超声检查是将探头放在腹部，通过超声波反射或者散射回信号，形成图像来进行检查。而胃镜是从口腔内进入，依次观察食管、胃和十二指肠的病变;

4、价格不同：一般情况下，胃肠超声检查比较简单、方便，价格也比较低。而胃镜检查的价格会有所增加，因为胃镜需要使用麻药，在麻醉药起效后，患者在做检查时不会有明显的不适感，但胃镜检查的价格会相对较高，一般在2000元以上。

无论是胃肠超声检查还是胃镜检查，都建议去正规医院进行检查，在做检查之前需要空腹，并且要配合医生做吞咽动作，以免影响检查结果。