超声检查甲状腺的最佳探头频率，需根据甲状腺的疾病进行具体分析。超声探头的频率取决于甲状腺疾病的类型，如甲状腺结节、甲状腺脓肿、甲状腺癌等。

1、甲状腺结节：对于良性的甲状腺结节，如常见的甲状腺乳头状瘤等，通常建议频率为每周3-4次，且每次探头需放置在距离甲状腺结节旁边1cm以内。如果超声提示甲状腺结节为恶性结节，如甲状腺癌，且为较大的结节，这时为保证肿瘤探测的一致性，也可以选择少量多次的超声探头探查，以免遗漏较小的结节;

2、甲状腺脓肿：对于甲状腺脓肿的患者，通常需要经常做超声检查，以观察脓肿壁的变化。如果脓肿壁表现为高回声、边界不清、脓肿壁厚度>2.5mm等，则可以诊断为甲状腺脓肿。对于甲状腺脓肿患者而言，一般应采取积极的抗感染治疗，当炎症得到控制后，超声检查时可以显示脓肿壁消失;

3、甲状腺癌：如果患者存在甲状腺癌，则建议选择超声频率为每周1次。当超声检查发现甲状腺存在结节、肿块时，应根据结节的大小、形态、边界、纵横比等方面，在专业医生的指导下选择是否进行穿刺活检或手术切除，并且建议一旦明确诊断为恶性肿瘤，应及时进行手术治疗。

除上述常见情况外，如果存在甲状腺功能亢进症等情况，通常也建议选择每周3次超声检查，频率一般较高。因此，超声检查甲状腺的最佳探头频率，需根据具体疾病类型决定。此外，对于超声检查发现甲状腺存在异常的患者，应及时进行血常规、CT、核磁共振等检查进一步明确诊断，并且及时治疗。